Creation date in repository: 2020-12-14

Abstract: Las especies del género Achromobacter corresponden a bacilos Gram negativos no fermentadores de la glucosa de distribución ubicua en el entorno. Estos microorganismos se aíslan ocasionalmente en muestras clínicas, siendo más frecuente el hallazgo en secreciones del tracto respiratorio que en otro tipo de especímenes. La detección de bacterias de este género en aislados de pacientes con fibrosis quística es cada vez más frecuente. Sin embargo, su significado clínico sigue siendo controvertido, probablemente por la escasez de casos reportados en la literatura. Este trabajo se centra en el estudio de la distribución y características principales asociadas al aislamiento de especies de Achromobacter recuperadas de muestras de tracto respiratorio en pacientes con fibrosis quística. Para la discriminación entre distintas especies se llevó a cabo la técnica de tipado MLST (multilocus sequence typing) y el posterior análisis bioinformático de las secuencias concatenadas para el establecimiento de relaciones filogenéticas. A. xylosoxidans se ha revelado como la especie aislada con una mayor frecuencia, además de ser la principal especie asociada con la colonización/infección crónica. No obstante, es necesario optimizar los protocolos para la amplificación de fragmentos de genes, puesto que errores en la amplificación impidieron la obtención de perfiles alélicos completos. Consecuentemente, se necesitarían estudios adicionales para poder comparar las características de los aislados en función de que sean puntuales o persistentes, para trazar una posible dispersión clonal de algún secuenciotipo. Les espècies del gènere Achromobacter corresponen a bacils Gram negatius no fermentadors de la glucosa de distribució ubiqua en l'entorn. Aquests microorganismes s'aïllen ocasionalment en mostres clíniques, sent més freqüent l’aïllament en secrecions del tracte respiratori que en altra mena d'espècimens. La detecció de bacteris d'aquest gènere en aïllats de pacients amb fibrosi quística és cada vegada més freqüent. No obstant això, el seu significat clínic continua sent controvertit, probablement per l'escassetat de casos reportats en la literatura. Aquest treball se centra en l'estudi de la distribució i característiques principals associades a l'aïllament d'espècies de Achromobacter recuperades de mostres de tracte respiratori en pacients amb fibrosi quística. Per a la discriminació entre diferents espècies es va dur a terme la tècnica de tipat MLST (multilocus sequence typing) i el posterior anàlisi bioinformàtic de les seqüències concatenades per a l'establiment de relacions filogenètiques. A. xylosoxidans s'ha revelat com l'espècie aïllada amb una major freqüència, a més de ser la principal espècie associada amb la colonització/infecció crònica. No obstant això, és necessari optimitzar els protocols per a l'amplificació de fragments de gens, ja que errors en l'amplificació van impedir l'obtenció de perfils al·lèlics complets. Conseqüentment, es necessitarien estudis addicionals per a poder comparar les característiques dels aïllats en funció que siguin puntuals o persistents, per a traçar una possible dispersió clonal d'algun seqüenciotip.

Subject: Bioquímica i biotecnologia

Language: Castellà

Subject areas: Ciencias de la salud Health sciences Ciències de la salut

Department: Bioquímica i Biotecnologia

Student: Ferre Giraldo, Adriana

Academic year: 2019-2020

Title in different languages: Estructura poblacional de especies de Achromobacter spp. aisladas de pacientes con fibrosis quística y perfiles de sensibilidad antimicrobianos Estructura poblacional de especies de Achromobacter spp. aisladas de pacientes con fibrosis quística y perfiles de sensibilidad antimicrobianos Estructura poblacional d'espècies d'Achromobacter spp. aïllades de pacients de pacients amb fibrosi quística i perfils de sensibilitat antimicrobians

Work's public defense date: 2020-09-04

Keywords: Achromobacter, fibrosis quística, antimicrobianos Achromobacter, cystic fibrosis, antimicrobials Achromobacter, fibrosi quística, antimicrobians

Confidenciality: No

TFG credits: 9

Title in original language: Estructura poblacional de especies de Achromobacter spp. aisladas de pacientes con fibrosis quística y perfiles de sensibilidad antimicrobianos

Project director: Martín Gómez, Mª Teresa

Education area(s): Biotecnologia

Entity: Universitat Rovira i Virgili (URV)