Keywords: preconcentració partícules víriques preconcentration viral particles preconcentración partículas víricas

Title in different languages: Pre-concentració de partícules víriques presents en mostres de femta per a posterior seqüenciació del viroma Pre-concentration of viral particles present in stool samples for subsequent viroma sequencing Pre-concentración de partículas víricas presente en muestras de heces para posterior secuenciación del viroma

Subject areas: Ciències de la salut Health sciences Ciencias de la salud

Confidenciality: No

Academic year: 2017-2018

Work's codirector: Romeu Figuerola, Antoni

Student: Kazakova, Polina

Department: Bioquímica i Biotecnologia

Access Rights: info:eu-repo/semantics/openAccess

Work's public defense date: 2018-06-26

TFM credits: 18

Project director: Torrell Galceran, Helena

Abstract: The intestinal viroma has been little studied in contrast to the intestinal microbiome because they were unable to grow virus, but thanks to new advances in the science of molecular genetics the studies from virome can be made by the sequencing of the viral genome. But in order to make such sequencing requires pre-treatment of fecal specimen as there are several factors that complicate this process one of the factors is one that is only a small part of nucleic acids that are found in the samples is from viral origin, in addition there is a low abundance of viral particles in the samples so it requires an enrichment process malware, prior to the extraction of nucleic acids. The studies from human intestinal viroma are important since it is a field with great potential to relate the presence of any virus with certain pathologies as well as studying the relationship with microbiota and the immune system of the host. La viroma intestinal ha estat poc estudiada en contrast amb el microbioma intestinal perquè no van poder cultivar virus, però gràcies als nous avenços en la ciència de la genètica molecular els estudis a partir de viroma es poden fer mitjançant la seqüenciació del genoma viral. Però per tal de fer aquesta seqüenciació es requereix un tractament previ de l'espècimen fecal, ja que hi ha diversos factors que compliquen aquest procés, un dels factors és un que és només una petita part dels àcids nucleics que es troben en les mostres és d'origen viral, a més hi ha una baixa abundància de partícules virals en les mostres, de manera que requereix un malware de procés d'enriquiment, abans de l'extracció d'àcids nucleics. Els estudis de la viroma intestinal humana són importants, ja que és un camp amb gran potencial per relacionar la presència de qualsevol virus amb certes patologies, així com estudiar la relació amb la microbiota i el sistema immunitari de l'hoste.

Subject: Ciències de la salut

Entity: Universitat Rovira i Virgili (URV)

Language: Castellà

Education area(s): Genètica, Física i Química Forense

Title in original language: Pre-concentración de partículas víricas presente en muestras de heces para posterior secuenciación del viroma

Creation date in repository: 2018-09-26