Desenvolupament d'una eina per a la reconstrucció de metabòlits a partir de l'espectre de masses dels metabòlits.

Identificador:  TFG:2131

Handle: https://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG2131

Autors:  Ruiz Botella, Manuel

Resum:
Actualment la metabolòmica és la secció de la biologia de sistemes que més problemes té a l'hora d'integrar-se en models biològics. Això es deu al fet que no hi ha una manera de seqüenciar un metabòlit tal com passa en altres ciències òmiques. A la metabolòmica s'utilitza l'accés a les bases de dades per comparar l'espectre d'un metabòlit amb els espectres guardats. Gràcies a la intel·ligència artificial es pot integrar la informàtica i la biologia de sistemes per resoldre aquesta limitació. Actualment hi ha un model d'intel·ligència artificial que és capaç de reconstruir molècules i generar noves molècules. El nostre treball es fonamenta en utilitzar un model d'intel·ligència artificial que sigui capaç de reconstruir i generar nous metabòlits. A més, hem desenvolupat una xarxa neuronal convolucional que s'integra amb aquest primer model i que permet reconstruir i generar nous metabòlits a partir de l'espectre de masses d'un metabòlit. El nostre model obté un 92,83% de reconstrucció per als metabòlits que es fan servir per generar-lo, i un 24,54% per als metabòlits que mai ha vist. El nostre model és capaç de determinar una molècula a partir del seu espectre de masses sense que sigui necessari que ningú hagi associat l'espectre de masses de la molècula a la molècula prèviament. Superant completament la metodologia actual de la metabolòmica per determinar un metabòlit d'una mostra biològica.