Identificació d'activity cliffs en compostos que s'uneixen a la proteasa Mpro del SARS-CoV-2

Identificador:  TFG:2968

Handle: https://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG2968

Autors:  Albert Cañamero, Òscar

Resum:
Els activity cliffs són parelles de compostos que presenten estructures molt similars però que tenen una diferència d’activitat molt alta. Aquests permeten capturar modificacions químiques que influeixen en l’activitat biològica, pel que són de gran utilitat i interès en l'anàlisi de la relació estructura-activitat dels compostos. En aquest projecte s’han buscat activity cliffs entre molècules que inhibeixen la Mpro del SARS-CoV-2 i molècules que no l’inhibeixen. Per a fer-ho s’ha desenvolupat una aplicació que permet trobar activity cliffs mitjançant la representació en un dendrograma de les molècules de dos arxius segons la seva similitud (un arxiu per a les molècules que inhibeixen la Mpro i un altre per a les que no l’inhibeixen). Per a calcular la similitud entre molècules s’utilitzen fingerprints i el càlcul de l’índex de Tanimoto entre els fingerprints de les diferents molècules. L’aplicació permet diferenciar quins compostos pertanyen a cada arxiu i mostra l’estructura de les molècules quan l’usuari interacciona amb el nom d’aquestes al dendrograma. En total s’han trobat 18 activity cliffs entre totes les molècules analitzades.