Predicció d'interaccions entre parelles i tripletes de gens a Saccharomyces cerevisiae utilitzant models de bloc estocàstic amb pertinença mixta

Identificador:  TFG:3033

Handle: https://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG3033

Autors:  Mariné Tena, Aleix

Resum:
En aquest projecte vam implementar un model matemàtic basat en Models de Blocs Estocàstics de Pertinença Mixta per poder fer prediccions de la força i tipus d'interacció genètica entre dos o tres gens de l'organisme model humà Saccharomyces cerevisiae. Utilitzem un conjunt de dades de 501.510 entrades obtingudes dels materials complementaris de l'article Anàlisi sistemàtica d'interaccions genètiques complexes. Aquest conjunt de dades conté les dades del fitness dels mutants knock-out triples i dobles de llevat, cadascun amb una combinació diferent de gens mutats. Després de validar les prediccions del model utilitzant diferents mètriques, comparem com es relacionen els gens segons els models de blocs estocàstics de membres mixta en termes de ontologia genètica.