Treballs Fi de Grau> Bioquímica i Biotecnologia

Computational study of the hydroxylation and epoxidation by the mutants of the PaDa-I peroxygenase variant

  • Dades identificatives

    Identificador: TFG:4452
    Handle: http://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG4452
  • Autors:

    Martínez Sugrañes, Mireia
  • Altres:

    Data d'alta al repositori: 2022-02-24
    Resum: Les peroxigenases inespecífiques (UPO) representen una nova família d'enzims fúngics hemotiolats amb alt interès biotecnològic. Molts d'aquests enzims s'han dissenyat, combinant eines d'evolució racional i dirigida amb mètodes de disseny computacional, per obtenir la selectivitat, l'eficiència i l'estabilitat requerides. Amb aquesta finalitat, s'ha utilitzat el programari Protein Energy Landscape Exploration (PELE). Utilitzant com a punt de partida el mutant UPO d'Agrocybe aegerita PaDa-I, vam caracteritzar l'especificitat, regio- i enantioselectivitat de trenta mutants contra cinc substrats. En el futur, aquests resultats ajudaran a realitzar anàlisis tant retrospectives com prospectives per combinar les millors mutacions en noves variants. Unspecific peroxygenases (UPOs) represent a new family of fungal heme-thiolate enzymes with high biotechnological interest. Many of these enzymes have been engineered, combining rational and directed evolution tools with computational design methods, to obtain the required selectivity, efficiency, and stability. For this purpose, the Protein Energy Landscape Exploration (PELE) software has been used. Using as departure point the UPO mutant from Agrocybe aegerita PaDa-I, we characterized the specificity, regio- and enantioselectivity of thirty mutants against five substrates. In the future, these results will help to perform both retrospective and prospective analysis to combine the best mutations in new variants.
    Matèria: Bioquímica i biotecnologia
    Idioma: en
    Àrees temàtiques: Bioquímica i biotecnologia Biochemistry and biotechnology Bioquímica y biotecnología
    Departament: Bioquímica i Biotecnologia
    Estudiant: Martínez Sugrañes, Mireia
    Curs acadèmic: 2020-2021
    Títol en diferents idiomes: Estudi computacional de la hidroxilació i epoxidació pels mutants de la variant de peroxygenasa PaDa-I Computational study of the hydroxylation and epoxidation by the mutants of the PaDa-I peroxygenase variant Estudio computacional de la hidroxilación y epoxidación de los mutantes de la variante de peroxygenasa PaDa-I
    Data de la defensa del treball: 2021-09-08
    Drets d'accés: info:eu-repo/semantics/openAccess
    Paraules clau: química computacional, PELE, peroxigenasa inespecífica fúngica computacional chemistry, PELE, fungal unspecific peroxygenase. química computacional, PELE, peroxigenasa inespecífica fúngica
    Confidencialitat: No
    Títol en la llengua original: Computational study of the hydroxylation and epoxidation by the mutants of the PaDa-I peroxygenase variant
    Director del projecte: Gómez Álvarez, Josep
    Ensenyament(s): Bioquímica i Biologia Molecular
    Entitat: Universitat Rovira i Virgili (URV)
  • Paraules clau:

    Bioquímica i biotecnologia
    Biochemistry and biotechnology
    Bioquímica y biotecnología
    Bioquímica i biotecnologia
  • Documents:

  • Cerca a google

    Search to google scholar