Anàlisis mutacional del lloc d'hibridació del SARS-CoV-2 per a primers de RT-qPCR en temps real i disseny de novo de primers específics per a la variant Omicron

Identificador:  TFG:5610

Handle: https://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG5610

Autors:  Novau Ferré, Nil

Resum:
El SARS-CoV-2 és la causa de la nova COVID-19 i encara no hi ha cap cura definitiva per a la malaltia. Per tant, és crític estudiar l'evolució mutacional del virus per detectar variants que podrien desenvolupar resistència viral als tractaments. En aquest treball, realitzem un perfil de mutació de més de 4.000.000 de genomes SARS-CoV-2. D'altra banda, les proves RT-qPCR per al SARS-CoV-2 s'enfronten a diverses dificultats, perquè a mesura que el virus evoluciona, l'enfocament pot perdre sensibilitat. Mesurem el nombre de desajustaments entre la seqüència d'encebadors i els objectius genòmics. A més, es mostra un disseny de primer específic de variants amb alta sensibilitat i especificitat a la variant Omicron.