Creation date in repository: 2022-07-22
Abstract: Aquaporin 4 (AQP4) is the most abundant aquaporin in the brain. Loss of AQP4 polarisation in the end-feet of astrocytes has been associated with many pathologies. It is believed that mislocalisation of AQP4 may happen due to protein-protein interactions. Therefore, this project focuses on screening a cDNA library from human brain mRNA to find new possible interaction partners of AQP4. To achieve this, bimolecular fluorescence complementation and fluorescence-activated cell sorting are used to achieve a higher-throughput screening. Two combinations have been tested, N-terminally tagged AQP4 or C-terminally tagged AQP4, combined with C-terminally tagged cDNA library. However, no positive hits have been found up to this date. L'aquaporina 4 (AQP4) és l'aquaporina més abundant al cervell. La pèrdua de polarització AQP4 als extrems dels peus dels astròcits s'ha associat a moltes patologies. Es creu que la localització errònia d'AQP4 pot ocórrer a causa de les interaccions proteïna-proteïna. Per tant, aquest projecte se centra a examinar una biblioteca d'ADNc a partir d'ARNm del cervell humà per trobar nous possibles socis d'interacció d'AQP4. Per aconseguir-ho, s'utilitzen la complementació de fluorescència bimolecular i la classificació de cèl·lules activades per fluorescència per aconseguir un cribratge de major rendiment. S'han provat dues combinacions, AQP4 marcat al terminal N o AQP4 etiquetat al terminal C, combinades amb la biblioteca d'ADNc etiquetada al terminal C. No obstant això, no s'ha trobat cap èxit positiu fins a aquesta data.
Subject: Biotecnologia
Language: en
Subject areas: Bioquímica i biotecnologia Biochemistry and biotechnology Bioquímica y biotecnología
Department: Bioquímica i Biotecnologia
Student: Ruiz Isant, Oriol
Academic year: 2021-2022
Title in different languages: Possibles proteïnes d'interacció amb l'aquaporina 4 humana en Saccharomyces cerevisiae Putative partners for human aquaporin 4 in Saccharomyces cerevisiae Posibles proteínas de interación con la aquaporina 4 humana en Saccharomyces cerevisiae
Work's public defense date: 2022-06-21
Access rights: info:eu-repo/semantics/openAccess
Keywords: Aquaporina 4, Interaccions proteïna-proteïna, Complementació de Fluorescència Bimolecular (BiFC) Aquaporin 4, Protein-protein interactions, Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC) Aquaporina 4, Interacciones proteína-proteína, Complementación de Fluorescencia Bimolecular (BiFC)
Confidenciality: No
TFG credits: 9
Title in original language: Putative partners for human aquaporin 4 in Saccharomyces cerevisiae
Project director: Cordero Otero, Ricardo Román
Education area(s): Biotecnologia
Entity: Universitat Rovira i Virgili (URV)
Repositori URV