Treballs Fi de Grau> Bioquímica i Biotecnologia

Are docking scores and IC50 values of PLpro inhibitors correlated?

  • Identification data

    Identifier: TFG:6617
  • Authors:

    Pasquali, Camilla
  • Others:

    Creation date in repository: 2024-01-12
    Abstract: The pandemic, called COVID-19, was caused by the SARS-CoV-2 virus. During the pandemic different pharmacological targets have been studied and papain-like protease and its inhibitors have been characterized in order to develop new drugs. Thus, this work aims to collect and analyse (by protein-ligand docking) some PLpro inhibitors whose enzymatic activity has been experimentally evaluated (IC50 values). So the objective of the analysis is to evaluate whether the docking scores obtained from protein-ligand docking and the experimentally measured IC50 values correlated. In this study, we have analysed 216 SARS-CoV-2 PLpro inhibitors and show that for PLpro there is no correlation La pandèmia, anomenada COVID-19, va ser causada pel virus SARS-CoV-2. Durant la pandèmia s'han estudiat diferents dianes farmacològiques i s'han caracteritzat la proteasa semblant a la papaïna i els seus inhibidors per tal de desenvolupar nous fàrmacs. Així, aquest treball pretén recollir i analitzar (per atracament proteïna-lligant) alguns inhibidors de PLpro l'activitat enzimàtica dels quals s'ha avaluat experimentalment (valors IC50). Per tant, l'objectiu de l'anàlisi és avaluar si les puntuacions d'acoblament obtingudes de l'acoblament proteïna-lligant i els valors d'IC50 mesurats experimentalment es correlacionen. En aquest estudi, hem analitzat 216 inhibidors del SARS-CoV-2 PLpro i hem demostrat que per a PLpro no hi ha correlació.
    Subject: Biotecnologia
    Language: en
    Subject areas: Bioquímica y biotecnología Biochemistry and biotechnology Bioquímica i biotecnologia
    Department: Bioquímica i Biotecnologia
    Student: Pasquali, Camilla
    Academic year: 2022-2023
    Title in different languages: Estan correlacionats els valors d'IC50 i docking scores dels inhibidors de la PLpro? Estan correlacionados los valores de IC50 y docking scores de los inhibidores de la PLpro?
    Work's public defense date: 2023-06-19
    Access rights: info:eu-repo/semantics/openAccess
    Keywords: SARS-CoV-2, PLpro, docking SARS-CoV-2, PLpro, docking SARS-CoV-2, PLpro, docking
    Confidenciality: No
    Title in original language: Are docking scores and IC50 values of PLpro inhibitors correlated?
    Project director: Garcia-Vallve, Santi
    Education area(s): Biotecnologia
    Entity: Universitat Rovira i Virgili (URV)
  • Keywords:

    Bioquímica y biotecnología
    Biochemistry and biotechnology
    Bioquímica i biotecnologia
    Biotecnologia
  • Documents:

  • Cerca a google

    Search to google scholar