Analisis comparativo entre dos software basados en R para la anotación de picos en datos de metabolomica no dirigida.

Identificador:  TFG:6577

Handle: https://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG6577

Autores:  Vall Carabasa, Júlia

Resumen:
La identificació de metabòlits és una tasca difícil en la metabolòmica basada en cromatografia líquida i espectrometria de masses no dirigida. L'anotació, el procés d'associar les característiques dels ions amb les molècules, és crucial per identificar els metabòlits. Aquest estudi va comparar dos programes de programari populars, CAMERA i CliqueMS, per a l'anotació màxima mitjançant el llenguatge de programació R. Es van utilitzar diverses funcions d'aquests paquets per anotar adductes, pèrdues neutres i isòtops en 29 mostres. Els pseudoespectres associats a cada grup de característiques es van avaluar mitjançant espectres de metabòlits de referència de la base de dades NIST. La selecció del programari depèn de les propietats de la mostra i dels objectius experimentals. CliqueMS proporciona una anotació detallada, mentre que els pseudoespectres de CAMERA s'alineen amb més precisió amb els espectres de referència, millorant la identificació de metabòlits.