Prediction of ligand-protein activity based on graph representation

Identificador:  TFG:6990

Handle: https://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG6990

Autores:  Navarro Garitano, Jon

Resumen:
La proteïna M-pro del COVID-19 és essencial per al procés d'infecció del virus. Interrompre el centre actiu d'aquest enzim condueix a la pèrdua de la funció d'aquest ia la incapacitat del virus per infectar cèl·lules. Per seleccionar quines molècules poden inhibir efectivament aquesta proteïna, és important conèixer lactivitat enzimàtica dels lligands sobre la M-pro. Per aconseguir això, es fa servir l'algorisme K-Nearest-Neighbor (KNN) juntament amb la mètrica de distància Graph Edit Distance (GED) per a la predicció de l'activitat enzimàtica dels lligands.