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Taxonomic affiliation of new genomes should be verified using average nucleotide identity and multilocus phylogenetic analysis

  • Dades identificatives

    Identificador: imarina:6388151
    Autors:
    Figueras MBeaz-Hidalgo RHossain MLiles M
    Resum:
    © 2014 Figueras et al. The average nucleotide identity (ANI) determines if two genomes belong to the same species. Using ANI, we detected mislabeled genomes and recommend verifying with ANI and multilocus phylogenetic analysis the species affiliations of the announced genomes. The slightly different results obtained with different ANI calculation software can potentially mislead taxonomic inferences.
  • Altres:

    Autor segons l'article: Figueras M; Beaz-Hidalgo R; Hossain M; Liles M
    Departament: Ciències Mèdiques Bàsiques
    Autor/s de la URV: BEAZ HIDALGO, ROXANA / Figueras Salvat, María Josefa
    Resum: © 2014 Figueras et al. The average nucleotide identity (ANI) determines if two genomes belong to the same species. Using ANI, we detected mislabeled genomes and recommend verifying with ANI and multilocus phylogenetic analysis the species affiliations of the announced genomes. The slightly different results obtained with different ANI calculation software can potentially mislead taxonomic inferences.
    Àrees temàtiques: Zootecnia / recursos pesqueiros Saúde coletiva Química Molecular biology Medicina veterinaria Medicina iii Medicina ii Medicina i Interdisciplinar Geociências Genetics Farmacia Ensino Engenharias iii Engenharias ii Engenharias i Ciências biológicas iii Ciências biológicas ii Ciências biológicas i Ciências ambientais Ciências agrárias i Ciência de alimentos Ciência da computação Biotecnología Biodiversidade Astronomia / física
    Accès a la llicència d'ús: https://creativecommons.org/licenses/by/3.0/es/
    ISSN: 21698287
    Adreça de correu electrònic de l'autor: mariajose.figueras@urv.cat
    Identificador de l'autor: 0000-0002-2268-8980
    Data d'alta del registre: 2023-03-11
    Versió de l'article dipositat: info:eu-repo/semantics/publishedVersion
    Enllaç font original: https://mra.asm.org/content/2/6/e00927-14
    Referència a l'article segons font original: Genome Announcements. 2 (6):
    Referència de l'ítem segons les normes APA: Figueras M; Beaz-Hidalgo R; Hossain M; Liles M (2014). Taxonomic affiliation of new genomes should be verified using average nucleotide identity and multilocus phylogenetic analysis. Genome Announcements, 2(6), -. DOI: 10.1128/genomeA.00927-14
    URL Document de llicència: https://repositori.urv.cat/ca/proteccio-de-dades/
    DOI de l'article: 10.1128/genomeA.00927-14
    Entitat: Universitat Rovira i Virgili
    Any de publicació de la revista: 2014
    Tipus de publicació: Journal Publications
  • Paraules clau:

    Genetics,Molecular Biology
    Zootecnia / recursos pesqueiros
    Saúde coletiva
    Química
    Molecular biology
    Medicina veterinaria
    Medicina iii
    Medicina ii
    Medicina i
    Interdisciplinar
    Geociências
    Genetics
    Farmacia
    Ensino
    Engenharias iii
    Engenharias ii
    Engenharias i
    Ciências biológicas iii
    Ciências biológicas ii
    Ciências biológicas i
    Ciências ambientais
    Ciências agrárias i
    Ciência de alimentos
    Ciência da computação
    Biotecnología
    Biodiversidade
    Astronomia / física
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