Identificador: TFG:9355
Autors: Miguel Rodríguez, Ignacio
Resum:
Les proteïnes són macromolècules essencials en els sistemes biològics, ja que participen en diverses funcions com el suport estructural, l’activitat enzimàtica i la senyalització. Per fer-ho, les proteïnes sovint interaccionen amb lligands. El reconeixement intermolecular és un procés clau per a diverses funcions biològiques, on interaccions governades per forces no covalents, com els enllaços d’hidrogen, les forces de Van der Waals, les interaccions electrostàtiques i els efectes hidrofòbics, són essencials. L’afinitat de lligand (una mesura de la força d’aquestes interaccions) es pot descriure amb paràmetres com , i 50. Aquests índexs, juntament amb dades d’interacció, són fonamentals en el disseny de fàrmacs, oferint informació valuosa sobre la potència i l’estabilitat dels complexos proteïna-lligand. Els treballs recents en el descobriment de fàrmacs assistit per ordinador (CADD) han transformat profundament el procés de desenvolupament de fàrmacs gràcies a l’ús de tècniques computacionals com el disseny de fàrmacs basat en estructura (SBDD) i el disseny de fàrmacs basat en lligands (LBDD). Mentre que el SBDD utilitza l’estructura tridimensional de les proteïnes diana per dissenyar i seleccionar lligands potencials, el LBDD construeix models basats en lligands coneguts per predir interaccions amb proteïnes diana. Ambdós mètodes es beneficien de bases de dades que cataloguen les interaccions proteïna-lligand, fent més eficient el desenvolupament de fàrmacs. Aquest treball proposa el desenvolupament d’una base de dades que faciliti l’estudi de les afinitats i les interaccions proteïna-lligand, ajudant a millorar les metodologies CADD i que es pugui utilitzar per perfeccionar la predicció d’afinitats per al descobriment de fàrmacs.
Repositori URV