Treballs Fi de Grau> Bioquímica i Biotecnologia

Cell cycle modelization through the study of the cell–cell and cell–matrix forces

  • Identification data

    Identifier: TFG:2130
    Handle: http://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG2130
  • Authors:

    Daudén Esmel, Cristòfol
  • Others:

    Creation date in repository: 2019-09-30
    Abstract: La proliferación de tejidos cancerosos está directamente relacionada con la velocidad del ciclo celular y su duración. Controlar, tanto los factores citológicos y fisicoquímicos que intervienen en el cambio de fase durante el ciclo celular, como los procesos que se llevan a cabo durante la división celular es necesario para el desarrollo de terapias eficaces contra estos tumores de rápida proliferación . Aunque durante mucho tiempo la regulación del ciclo celular ha sido objeto de un estudio extensivo, no hay ninguna evaluación sobre si se puede predecir cuando una célula se dividirá o no. Así, en este proyecto, hemos desarrollado un modelo estadístico que nos permitirá predecir cuando una célula cambiará su fase de ciclo celular, concretamente, cuando pasará la transición entre la fase G1 y la fase S. Los experimentos realizados han generado algunos modelos prometedores que tienen buenos resultados en nuestro conjunto de datos y también han mostrado los factores más prometedores en la predicción de este cambio de fase, como el área citoplasmática acumulada, las fuerzas instantáneas de tensión y de tracción y las energías acumuladas. (Calculadas como el producto entre el área celular y las fuerzas). The proliferation of cancerous tissues is directly related with the cell cycle speed and its duration. Control the cytological and physical-chemical factors that are involved in the phase change over the cell cycle and the cell division processes is necessary for the development of effective therapies for rapidly proliferating tumors. Even though the regulation of the cell cycle has been a subject of extensive study for a long time, there are no still assessments of whether we can predict when a cell is going to divide or not. So, in this project, we have developed a statistical model that will allow us to predict when a cell is going to change its cell cycle phase, specifically, when the transition between the G1 phase and the S phase is going to happen. The experiments carried out have generated some promising models that have quite good results on our dataset and also have shown the most promising factors in the prediction of this phase changing, such as the cumulative cytoplasmic area, the instantaneous tension and traction forces and the cumulative energies (calculated as the product between the cell area and the forces). La proliferació de teixits cancerosos està directament relacionada amb la velocitat del cicle cel·lular i la seva durada. Controlar, tant els factors citològics i fisicoquímics que intervenen en el canvi de fase durant el cicle cel·lular, com els processos que es duen a terme durant la divisió cel·lular és necessari per al desenvolupament de teràpies eficaces contra aquests tumors de ràpida proliferació. Tot i que durant molt de temps la regulació del cicle cel·lular ha estat objecte d'un estudi extensiu, no hi ha cap avaluació sobre si es pot predir quan una cèl·lula es dividirà o no. Així, en aquest projecte, hem desenvolupat un model estadístic que ens permetrà predir quan una cèl·lula canviarà la seva fase de cicle cel·lular, concretament, quan passarà la transició entre la fase G1 i la fase S. Els experiments realitzats han generat alguns models prometedors que tenen bons resultats en el nostre conjunt de dades i també han mostrat els factors més prometedors en la predicció d'aquest canvi de fase, com l'àrea citoplasmàtica acumulada, les forces instantànies de tensió i de tracció i les energies acumulades. (calculades com el producte entre l'àrea cel·lular i les forces).
    Subject: Bioquímica i biotecnologia
    Language: en
    Subject areas: Bioquímica y biotecnología Biochemistry and biotechnology Bioquímica i biotecnologia
    Department: Bioquímica i Biotecnologia
    Student: Daudén Esmel, Cristòfol
    Academic year: 2018-2019
    Title in different languages: Modelización del ciclo celular mediante el estudio de las fuerzas ejercidas entre células y entre célula y matriz extracelular Cell cycle modelization through the study of the cell–cell and cell–matrix forces Modelització del cicle cel·lular mitjançant l'estudi de les forces exercides entre cèl·lules i entre cèl·lula i matriu extracel·lular
    Work's public defense date: 2019-06-27
    Access rights: info:eu-repo/semantics/openAccess
    Keywords: bioinformática; ciclo celular; modelización bioinformatics; cellular cycle; modeling bioinformàtica; cicle cel·lular; modelizació
    Confidenciality: No
    TFG credits: 9
    Title in original language: Cell cycle modelization through the study of the cell–cell and cell–matrix forces
    Project director: Sales-Pardo, Marta
    Education area(s): Biotecnologia
    Entity: Universitat Rovira i Virgili (URV)
  • Keywords:

    Bioquímica y biotecnología
    Biochemistry and biotechnology
    Bioquímica i biotecnologia
    Bioquímica i biotecnologia
  • Documents:

  • Cerca a google

    Search to google scholar