Creation date in repository: 2019-09-30

Abstract: Karlodinium armiger és una microalga tòxica que genera un fort impacte a molts ambients marins. Per aquest motiu cal un mètode de detecció d'aquesta microalga. Encara que hi ha mètodes de detecció al laboratori, aquests són molt costosos i necessiten personal especialitzat. Per a una ràpida detecció que es pugui dur a terme a qualsevol lloc, és necessari el desenvolupament d'un biosensor ASSURED (Affordable, Sensitive, Specific, User-friendly, Rapid and Robust, Equipment free, Deliverable to all end-users). Per desenvolupar aquest biosensor és necessari establir un sistema de detecció estàndard per basar els estudis. Fins ara, s'està treballant amb sistemes de detecció colorimètrics com ara RPA-ELONA. Tot i això, els assajos ELONA actuals es realitzen en plaques activades amb Maleimida, fet que suposa una despesa més gran i una manipulació complexa. Per aquest motiu, aquest treball se centra en el desenvolupament d'un sistema de detecció RPA-ELONA basat en l'ús de polilisina. Aquest nou sistema seria més econòmic, pel preu de les plaques i dels reactius que es necessiten. Els resultats obtinguts mostren que aquest sistema permet una detecció de K. armiger amb una sensibilitat molt propera a la dels assaigs ELONA en plaques de maleimida. Per tant, aquest sistema de detecció és molt prometedor. Tot i això, posteriors estudis podrien optimitzar aquest sistema fent-lo més sensible. Paraules clau: ASSURET, RPA, PLL, ELONA, Maleimida, Karlodinium armiger. Karlodinium armiger is a toxic microalgae which affects coastal ecosystems by releasing a toxin. For this reason, a Karlodinium detection system is needed. Although there have already been developed some detection methods, those are expensive, and they need specialized workers. In order to avoid these problems, it’s necessary to develop an ASSURED biosensor (Affordable, Sensitive, Specific, User-friendly, Rapid and Robust, Equipment free, Deliverable to all end-users). The first step in the biosensor development is to set up a basic standard detection method for basing the following studies. One of the detection methods is RPA-ELONA. However, actually the ELONA assays are done in maleimide plates, which make this method expensive and complex. Due to this, this project will work in the development of a new RPA-ELONA using plates with poly-l-lysine (PLL). This new system would be cheaper, because of the price of the plates and the reagents needed. The results obtained here demonstrate this system can detect K. armiger DNA nearly like maleimide plates did. Therefore, this detection system it’s very promising. Nevertheless, more studies should optimize this system making it more sensitive. Key words: ASSURED, RPA, PLL , ELONA, Maleimide, Karlodinium armiger Karlodinium armiger es una microalga tóxica que genera un fuerte impacto en muchos ambientes marinos. Por este motivo, es necesario un método de detección de esta microalga. Aunque existen métodos de detección en laboratorio, estos son muy costosos y necesitan personal especializado. Para una rápida detección que se pueda llevar a cabo en cualquier lugar, es necesario el desarrollo de un biosensor ASSURED (Affordable, Sensitive, Specific, User-friendly, Rapid and Robust, Equipment free, Deliverable to all end-users). Para desarrollar este biosensor es necesario establecer un sistema de detección estándar en que basar los estudios. Hasta ahora, se esta trabajando con sistemas de detección colorimétricos como RPA-ELONA. Sin embargo, los ensayos ELONA actuales se realizan en placas activadas con Maleimida, lo que supone un gasto más grande y una manipulación compleja. Por este motivo, este trabajo se centra en el desarrollo de un sistema de detección RPA-ELONA basado en el uso de polilisina. Este nuevo sistema, sería más económico, por el precio de las placas y de los reactivos que se necesitan. Los resultados obtenidos muestran que este sistema permite una detección de K. armiger con una sensibilidad muy cercana a la de los ensayos ELONA en placas de maleimida. Por tanto, este sistema de detección es muy prometedor. Sin embargo, posteriores estudios podrían optimizar este sistema haciéndolo más sensible. Palabras clave: ASSURED, RPA, PLL , ELONA, Maleimida, Karlodinium armiger

Subject: Bioquímica i biotecnologia

Language: spa

Subject areas: Bioquímica i biotecnologia Biochemistry and biotechnology Bioquímica y biotecnología

Department: Bioquímica i Biotecnologia

Student: Vera Gómez, Iván

Academic year: 2018-2019

Title in different languages: Desenvolupament d'un nou sistema de detecció de Karlodinium armiger mitjançant un Enzyme-linked oligonucleotide assay basat en polilisina. Development of a new detection system for Karlodinium armiger using Enzyme-linked oligonucleotide assay based in polilisine Desarrollo de un nuevo sistema de detección de Karlodinium armiger mediante un Enzyme-linked oligonucleotide assay basado en polilisina.

Work's public defense date: 2019-06-27

Access rights: info:eu-repo/semantics/openAccess

Keywords: ELONA, Karlodinium armiger, RPA ELONA, Karlodinium armiger, RPA ELONA, Karlodinium armiger, RPA

Confidenciality: No

TFG credits: 9

Title in original language: Desarrollo de un nuevo sistema de detección de Karlodinium armiger mediante un Enzyme-linked oligonucleotide assay basado en polilisina.

Project director: Masip Vernis, Lluis; Katakis, Ioanis

Education area(s): Biotecnologia

Entity: Universitat Rovira i Virgili (URV)