Creation date in repository: 2022-02-07
Abstract: Un dels principals problemes de la metabolòmica no dirigida (untargeted) és la baixa cobertura de metabòlits identificats. Presentem un software de metabolòmica semi-dirigida per l’anàlisi de dades LC-MS1 i LC-MS2 (RHermes), que permet la identificació de milers de compostos presents en una mostra. L’estratègia es basa en una anotació específica de les dades MS1 a partir d’una base de dades de formules moleculars i adductes, seguida d’una adquisició de dades LC-MS2 per identificar els compostos. Per validar l’especificitat biològica d’Hermes, s’han analitzat mostres d’Escherichia coli cultivada en un medi marcat amb 13C-glucosa i un medi control sense marcar.
Subject: Bioquímica i biotecnologia
Language: cat
Subject areas: Bioquímica i biotecnologia Biochemistry and biotechnology Bioquímica y biotecnología
Department: Bioquímica i Biotecnologia
Student: Giné Bertomeu, Roger
Academic year: 2020-2021
Title in different languages: Caracterització dirigida d'ample abast del metaboloma Escherichia coli mitjançant LC-MS1 i LC-MS2 Broad-scoped characterization of the Escherichia coli metabolome with LC-MS1 and LC-MS2 Caracterización dirigida de amplio alcance del metaboloma de Escherichia coli por LC-MS1 y LC-MS2
Work's public defense date: 2021-06-21
Access rights: info:eu-repo/semantics/openAccess
Keywords: metabolòmica, marcatge d'isòtops estables, DDA metabolomics, stable-isotope labelling, DDA metabolómica, marcaje de isótopos estables, DDA
Confidenciality: No
Title in original language: Caracterització dirigida d'ample abast del metaboloma Escherichia coli mitjançant LC-MS1 i LC-MS2
Project director: Cordero Otero, Ricardo Román
Education area(s): Biotecnologia
Entity: Universitat Rovira i Virgili (URV)
Repositori URV