Optimization of Genomic Analysis through the Integration of Lithops in Nextflow

Identifier:  TFG:6952

Handle: https://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG6952

Authors:  Álvarez Ruiz, Miquel

Abstract:
L'estudi es va enfocar a Nextflow, una eina per processar dades a gran escala en entorns distribuïts. Nextflow s'utilitza a la comunitat científica per orquestrar fluxos de treball complexos, permetent executar tasques en paral·lel i treballar en entorns de computació al núvol. L'objectiu principal va ser desenvolupar un plugin personalitzat per a Nextflow que utilitzés Lithops com a executor de tasques. Lithops és una plataforma sense servidor que executa codi en entorns cloud, cosa que millora l'escalabilitat i eficiència en el processament de dades genòmics. Aquest estudi contribueix a la genòmica en integrar Lithops a Nextflow.