Optimització i paral·lelitzat d'un algorisme per realitzar un test de nestedness d'una matriu binaria

Creation date in repository: 2025-05-25

Abstract: En el grup de recerca SEES:lab es va dissenyar un algorisme en Python per esbrinar si la microbiota intestinal d'un conjunt de vertebrats segueix un patró nested. No obstant, aquest algorisme trigava massa temps en proporcionar els resultats i se n'ha volgut millorar el rendiment. Per tant, s’ha traduït el codi a C, s'han optimitzat algunes seccions i s'ha aplicat paral·lelisme amb OpenMP i MPI. A més, s’han fet proves d’execució en les màquines del zoo Orca i Pop i en la Sala dels Mac per avaluar l’evolució al augmentar el número d’unitats d’execució.

Subject: Optimització matemàtica--Informàtica

Language: ca

Subject areas: Ingeniería informática; Computer engineering; Enginyeria informàtica

Department: Enginyeria Informàtica i Matemàtiques

Student: Ferrero Ramos, Arey

Academic year: 2023-2024

Title in different languages: Optimización y paralelizado de un algoritmo para realizar un test de nestedness de una matriz binaria; Optimization and parallelization of an algorithm to perform a nestedness test of a binary matrix; Optimització i paral·lelitzat d'un algorisme per realitzar un test de nestedness d'una matriu binaria

Work's public defense date: 2024-02-01

Access rights: info:eu-repo/semantics/openAccess

Keywords: matriz nested, optimización de código, paralelismo; nested matrix, code optimization, parallelism; matriu nested, optimització de codi, paral·lelisme

Confidenciality: No

Title in original language: Optimització i paral·lelitzat d'un algorisme per realitzar un test de nestedness d'una matriu binaria

Project director: Aliagas Castell, Carlos

Education area(s): Enginyeria Informàtica

Entity: Universitat Rovira i Virgili (URV)