Fecha de alta en el repositorio: 2024-01-09
Resumen: Syntenin-1 is an overexpressed protein in aggressive versions of certain cancers. It has been observed that its inhibition could decrease tumor proliferation. In this project, we used a virtual screening workflow in order to find potential inhibitory molecules that could bind to its PDZ2 domain binding site. We performed a molecular ligand docking of a large library of commercial compounds and developed a pharmacophore model based on the SYNTi ligand in order to filter the molecules that didn't have certain features required for a potent inhibition. This project resulted in a set of 6 molecules that could potentially inhibit syntenin-1 activity. La sintenina-1 és una proteïna sobreexpressada en versions agressives de certs càncers. S'ha observat que la seva inhibició podria disminuir la proliferació tumoral. En aquest projecte, hem utilitzat un flux de treball de cribratge virtual per trobar molècules inhibidores potencials que podrien unir-se al seu lloc d'unió al domini PDZ2. Vam realitzar un acoblament de lligands moleculars d'una gran biblioteca de compostos comercials i vam desenvolupar un model de farmacofor basat en el lligand SYNTi per tal de filtrar les molècules que no tenien certes característiques necessàries per a una inhibició potent. Aquest projecte va donar lloc a un conjunt de 6 molècules que potencialment podrien inhibir l'activitat de la sintenina-1.
Materia: Càncer
Idioma: en
Áreas temáticas: Bioquímica y biotecnología Biochemistry and biotechnology Bioquímica i biotecnologia
Departamento: Bioquímica i Biotecnologia
Estudiante: Arasa Estivill, Guillem
Curso académico: 2022-2023
Título en diferentes idiomas: Virtual screening para agentes anticancerígenos contra el dominio PDZ2 de la sintenina-1 Virtual screening per agents anticancerígens enfront el domini PDZ2 de la sintenina-1
Fecha de la defensa del treball: 2023-06-20
Derechos de acceso: info:eu-repo/semantics/openAccess
Palabras clave: mda-9, PDZ2, molecular docking mda-9, PDZ2, molecular docking mda-9, PDZ2, molecular docking
Confidencialidad: No
Título en la lengua original: Virtual screening for novel anticancer agents targeting the PDZ2 domain of syntenin-1
Director del proyecto: Pujadas Anguiano, Gerard
Enseñanza(s): Biotecnologia
Entidad: Universitat Rovira i Virgili (URV)
Repositori URV