Keywords: Principios FAIR, OMOP CDM, interoperabilidad FAIR principles, OMOP CDM, interoperability Principis FAIR, OMOP CDM, interoperabilitat
Title in different languages: El proyecto DATOS-CAT: Aprovechamiento de OMOP CDM para la estandarización, integración y análisis de datos biomédicos poblacionales en Cataluña The DATOS-CAT project: Leveraging OMOP CDM for the standardization, integration and analysis of population-based biomedical data in Catalonia El projecte DATOS-CAT: Aprofitament de OMOP CDM per a l'estandardització, integració i anàlisi de dades biomèdiques poblacionals a Catalunya
Subject areas: Ciencias de la salud Health sciences Ciències de la salut
Confidenciality: No
Academic year: 2023-2024
Student: Martinez Gonzalez, Judith
APS: No
Department: Enginyeria Informàtica i Matemàtiques
Access Rights: info:eu-repo/semantics/openAccess
Work's public defense date: 2024-06-20
Project director: Labarga Gutiérrez, Alberto
Abstract: This master's thesis contributes to the DATOS-CAT project by developing guidelines, tools, and protocols to improve the interoperability and visibility of the GCAT cohort and the COVICAT-CONTENT sub-cohort, aligning with FAIR principles and European Commission policies. It defines data flow and evaluates different technologies, addressing key aspects like creating a data catalog and standardizing data to a common model. Two Extract-Load-Transform approaches are evaluated: data engineering tools and semantic technologies. The study emphasizes developing platforms for data discovery and federated analysis while ensuring privacy and security, providing a roadmap for future health project improvements. Aquest treball de fi de màster contribueix al projecte DATOS-CAT desenvolupant directrius, eines i protocols per millorar la interoperabilitat i la visibilitat de la cohort GCAT i la subcohort COVICAT-CONTENT, alineant-se amb els principis FAIR i les polítiques de la Comissió Europea. Defineix el flux de dades i avalua diferents tecnologies, abordant aspectes clau com la creació d'un catàleg de dades i l'estandardització de dades a un model comú. S'avaluen dos enfocaments Extract-Load-Transform: eines d'enginyeria de dades i tecnologies semàntiques. L'estudi posa l'accent en el desenvolupament de plataformes per al descobriment de dades i l'anàlisi federada alhora que garanteix la privadesa i la seguretat, proporcionant un full de ruta per a futures millores de projectes de salut.
Subject: Bioinformàtica
Entity: Universitat Rovira i Virgili (URV)
Language: en
Education area(s): Ciència de Dades Biomèdiques
Title in original language: The DATOS-CAT project: Leveraging OMOP CDM for the standardization, integration and analysis of population-based biomedical data in Catalonia
Creation date in repository: 2025-03-03
Repositori URV