A novel real-time editor for protein-ligand binding affinity prediction using structural comparison

Entidad: Universitat Rovira i Virgili (URV)

Confidencialidad: No

Enseñanza(s): Enginyeria de la Seguretat Informàtica i Intel·ligència Artificial

APS: No

Título en diferentes idiomas: Un nuevo editor en tiempo real para predecir la afinidad de unión proteína-ligando mediante comparación estructural

Resumen: Esta tesis presenta un método novedoso para la predicción de la afinidad de unión proteína-ligando, integrando comparaciones estructurales mediante la Distancia de Edición de Grafos (GED) y descriptores moleculares. Se desarrolla un editor gráfico en tiempo real para visualizar estructuras moleculares, calcular la GED y comparar afinidades de unión. Los resultados experimentales en el conjunto de datos de la proteasa principal del SARS-CoV-2 demuestran la eficiencia del enfoque, combinando interpretabilidad y precisión predictiva. Además, se utiliza un modelo de K-vecinos más cercanos (KNN) para la predicción de afinidad, con el apoyo de herramientas de análisis de errores cuantitativos y visualización. Esta investigación se alinea con los esfuerzos actuales de la Universitat Rovira i Virgili (URV) para innovar en los métodos computacionales de descubrimiento de fármacos, haciendo hincapié en la transparencia y las aplicaciones prácticas en quimioinformática.

Materia: Proteïnes

Curso académico: 2024-2025

Idioma: en

Fecha de la defensa del trabajo: 2025-06-12

Áreas temàticas: Ingeniería informática

Estudiante: Parade Patil, Kuldeep Shivaji

Departamento: Enginyeria Informàtica i Matemàtiques

Fecha de alta en el repositorio: 2026-03-13

Creditos del TFM: 9

Palabras clave: editor tiempo real, afinidad unión, comparación estructural

Título en la lengua original: A novel real-time editor for protein-ligand binding affinity prediction using structural comparison

Derechos de Accesso: info:eu-repo/semantics/openAccess

Director del proyecto: Serratosa Casanelles, Francesc d'Assís