Creation date in repository: 2023-12-18
Abstract: This study focuses on establishing the optimal experimental conditions for detecting long noncoding RNAs (lncRNAs) which are tumour-derived products present in pleural fluid (PF). A qPCR assay was conducted to evaluate the impact of different initial sample volumes, the inclusion of an RNA spike-in (cel-miR-39) during the extraction process and the implementation of a preamplification step. The results suggest that the optimal conditions for lncRNA extraction from PF involve an initial volume of 200μL, the addition of cel-miR-39 and carrying out of a preamplification procedure. Furthermore, ACTB and GAPDH were validated as reference genes for data normalisation in PF samples. Aquest estudi se centra a establir les condicions experimentals òptimes per detectar ARN llargs no codificants (lncRNAs) que són productes derivats del tumor presents al líquid pleural (PF). Es va dur a terme un assaig de qPCR per avaluar l'impacte de diferents volums de mostra inicials, la inclusió d'una punta d'ARN (cel-miR-39) durant el procés d'extracció i la implementació d'un pas de preamplificació. Els resultats suggereixen que les condicions òptimes per a l'extracció de lncRNA de PF impliquen un volum inicial de 200 μL, l'addició de cel-miR-39 i la realització d'un procediment de preamplificació. A més, ACTB i GAPDH es van validar com a gens de referència per a la normalització de dades en mostres de PF.
Subject: Embassament pleural
Language: en
Subject areas: Bioquímica y biotecnología Biochemistry and biotechnology Bioquímica i biotecnologia
Department: Bioquímica i Biotecnologia
Student: Serrano Ribes, Núria
Academic year: 2022-2023
Title in different languages: Enfoques Experimentales para la Detección de Long Noncoding RNAs en Derrame Pleural Maligno Enfocaments Experimentals per a la Detecció de Long Noncoding RNAs en Embassament Pleural Maligne
Work's public defense date: 2023-06-21
Access rights: info:eu-repo/semantics/openAccess
Keywords: Derrame Pleural Maligno, biomarcador, lncRNA Malignant pleural effusion, biomarker, lncRNA Embassament pleural maligne, biomarcador, lncRNA
Confidenciality: No
Title in original language: Experimental Approaches for Detecting Long Noncoding RNAs in Malignant Pleural Effusion
Project director: Torrell Galceran, Helena
Education area(s): Bioquímica i Biologia Molecular
Entity: Universitat Rovira i Virgili (URV)
Repositori URV