Treballs Fi de Grau> Bioquímica i Biotecnologia

Experimental Approaches for Detecting Long Noncoding RNAs in Malignant Pleural Effusion

  • Datos identificativos

    Identificador: TFG:6581
  • Autores:

    Serrano Ribes, Núria
  • Otros:

    Fecha de alta en el repositorio: 2023-12-18
    Resumen: This study focuses on establishing the optimal experimental conditions for detecting long noncoding RNAs (lncRNAs) which are tumour-derived products present in pleural fluid (PF). A qPCR assay was conducted to evaluate the impact of different initial sample volumes, the inclusion of an RNA spike-in (cel-miR-39) during the extraction process and the implementation of a preamplification step. The results suggest that the optimal conditions for lncRNA extraction from PF involve an initial volume of 200μL, the addition of cel-miR-39 and carrying out of a preamplification procedure. Furthermore, ACTB and GAPDH were validated as reference genes for data normalisation in PF samples. Aquest estudi se centra a establir les condicions experimentals òptimes per detectar ARN llargs no codificants (lncRNAs) que són productes derivats del tumor presents al líquid pleural (PF). Es va dur a terme un assaig de qPCR per avaluar l'impacte de diferents volums de mostra inicials, la inclusió d'una punta d'ARN (cel-miR-39) durant el procés d'extracció i la implementació d'un pas de preamplificació. Els resultats suggereixen que les condicions òptimes per a l'extracció de lncRNA de PF impliquen un volum inicial de 200 μL, l'addició de cel-miR-39 i la realització d'un procediment de preamplificació. A més, ACTB i GAPDH es van validar com a gens de referència per a la normalització de dades en mostres de PF.
    Materia: Embassament pleural
    Idioma: en
    Áreas temáticas: Bioquímica y biotecnología Biochemistry and biotechnology Bioquímica i biotecnologia
    Departamento: Bioquímica i Biotecnologia
    Estudiante: Serrano Ribes, Núria
    Curso académico: 2022-2023
    Título en diferentes idiomas: Enfoques Experimentales para la Detección de Long Noncoding RNAs en Derrame Pleural Maligno Enfocaments Experimentals per a la Detecció de Long Noncoding RNAs en Embassament Pleural Maligne
    Fecha de la defensa del treball: 2023-06-21
    Derechos de acceso: info:eu-repo/semantics/openAccess
    Palabras clave: Derrame Pleural Maligno, biomarcador, lncRNA Malignant pleural effusion, biomarker, lncRNA Embassament pleural maligne, biomarcador, lncRNA
    Confidencialidad: No
    Título en la lengua original: Experimental Approaches for Detecting Long Noncoding RNAs in Malignant Pleural Effusion
    Director del proyecto: Torrell Galceran, Helena
    Enseñanza(s): Bioquímica i Biologia Molecular
    Entidad: Universitat Rovira i Virgili (URV)
  • Palabras clave:

    Bioquímica y biotecnología
    Biochemistry and biotechnology
    Bioquímica i biotecnologia
    Embassament pleural
  • Documentos:

  • Cerca a google

    Search to google scholar