Prediction and characterization of microrna-like rnas in fungal and fungal-like pathogens

Creation date in repository: 2025-03-14

Abstract: This project analyzes small RNA sequencing data from plant pathogens, including two fungal species (Botrytis cinerea and Fusarium oxysporum) and two oomycete species (Phytophthora infestans and Phytophthora parasitica). Using bioinformatics methods, microRNA-like RNAs (milRNAs) were identified and characterized in these species, predicting their secondary structures and potential gene targets. The goal is to enhance the understanding of the role of milRNAs in fungal and oomycete pathogenesis, with the potential to develop new biomarkers and therapies for diseases caused by these pathogens.; Aquest projecte analitza petites dades de seqüenciació d'ARN de patògens vegetals, incloses dues espècies de fongs (Botrytis cinerea i Fusarium oxysporum) i dues espècies d'oomicets (Phytophthora infestans i Phytophthora parasitica). Mitjançant mètodes bioinformàtics, es van identificar i caracteritzar ARN similars a microRNA (milRNAs) en aquestes espècies, predint les seves estructures secundàries i potencials objectius genètics. L'objectiu és millorar la comprensió del paper dels milRNAs en la patogènesi de fongs i oomicets, amb el potencial de desenvolupar nous biomarcadors i teràpies per a malalties causades per aquests patògens.

Subject: Microorganismes patògens

Language: en

Subject areas: Bioquímica y biotecnología; Biochemistry and biotechnology; Bioquímica i biotecnologia

Department: Bioquímica i Biotecnologia

Student: Cardona Ferrer, Ivan

Academic year: 2023-2024

Title in different languages: Predicción y caracterización de microrna-like rnas en patógenos fúngicos y similares; Predicció i caracterització de microrna-like rnas en patògens fúngics i similars

Work's public defense date: 2024-09-17

Access rights: info:eu-repo/semantics/openAccess

Keywords: Análisis bioinformático, Patógenos fúngicos, MicroRNA-like RNAs; Bioinformatic analysis, Fungal pathogens, MicroRNA-like RNAs; Anàlisi bioinformàtic, Patògens fúngics, MicroRNA-like RNAs

Confidenciality: No

Title in original language: Prediction and characterization of microrna-like rnas in fungal and fungal-like pathogens

Project director: Capilla Luque, Javier

Education area(s): Biotecnologia

Entity: Universitat Rovira i Virgili (URV)