Development of a SAR-Guided Virtual Screening Strategy to Identify Allosteric Inhibitors of Zika Virus NS2B/NS3 Protease

Creation date in repository: 2026-01-15

Abstract: Zika virus remains a global health concern due to its reemerging risk, severe complications, and lack of vaccines or antiviral therapies. The NS2B/NS3 protease is an attractive target, as it processes the viral polyprotein. However, direct active-site inhibition has been challenged by poor inhibitor permeability and active-site similarity to human serine proteases. To address this, an allosteric inhibition strategy was pursued, aiming to stabilize the inactive conformation of the protease. Structure-activity relationships of known allosteric inhibitors were analyzed and integrated into a virtual screening workflow. This approach yielded twenty potential allosteric inhibitors for future experimental evaluation.; El virus Zika continua sent un problema de salut mundial a causa del seu risc de reaparició, les complicacions greus i la manca de vacunes o teràpies antivirals. La proteasa NS2B/NS3 és una diana atractiva, ja que processa la poliproteïna viral. Tanmateix, la inhibició directa del lloc actiu s'ha vist desafiada per la baixa permeabilitat de l'inhibidor i la similitud del lloc actiu amb les proteases de serina humanes. Per solucionar-ho, es va dur a terme una estratègia d'inhibició al·lostèrica, amb l'objectiu d'estabilitzar la conformació inactiva de la proteasa. Es van analitzar les relacions estructura-activitat dels inhibidors al·lostèrics coneguts i es van integrar en un flux de treball de cribratge virtual. Aquest enfocament va produir vint inhibidors al·lostèrics potencials per a una futura avaluació experimental.

Subject: Virus

Language: ca

Subject areas: Bioquímica y Tecnología; Biochemistry and Technology; Bioquímica i Tecnologia

Department: Bioquímica i Biotecnologia

Student: Montano Hernández, Judith

Academic year: 2024-2025

Title in different languages: Desarrollo de una Estrategia de Cribado Virtual Guiada por SAR para Identificar Inhibidores Alostéricos de la Proteasa NS2B/NS3 del Virus del Zika; Development of a SAR-Guided Virtual Screening Strategy to Identify Allosteric Inhibitors of Zika Virus NS2B/NS3 Protease; Desenvolupament d'una Estratègia de Cribratge Virtual Guiada per SAR per Identificar Inhibidors Al·lostèrics de la Proteasa NS2B/NS3 del Virus del Zika

Work's public defense date: 2025-09-09

Access rights: info:eu-repo/semantics/openAccess

Keywords: Zika, Cribado Virtual, Inhibidores Alostéricos; Zika, Virtual Screening, Allosteric Inhibitors; Zika, Cribratge Virtual, Inhibidors Al·lostèrics

Confidenciality: No

TFG credits: 12

Title in original language: Development of a SAR-guided virtual screening strategy to identify allosteric inhibitors of zika virus NS2B/NS3 protease

Project director: Pujadas Anguiano, Gerard

Education area(s): Grau de Biotecnologia

Entity: Universitat Rovira i Virgili (URV)