Caracterización de cepas probióticas para su uso como alternativas a los antibióticos en la producción aviar

Identificador:  TFG:3007

Handle: https://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG3007

Autores:  Sáez Fuertes, Laura

Resumen:
El aumento de consumo de carne ha incrementado el uso de antibióticos mejorando el rendimiento animal, pero propiciando la aparición de resistencias antimicrobianas. La UE prohibió el uso de antibióticos como promotores de crecimiento (2006), generando una intensa búsqueda de productos alternativos con efectos beneficiosos similares a los antibióticos, entre los que destacan los probióticos. Los recientes avances en secuenciación masiva hacen económicamente viable el análisis genético completo de cepas bacterianas, permitiendo discernir los genes específicos que confieren capacidad probiótica. El objetivo de este trabajo es desarrollar una novedosa herramienta, basada en la caracterización de genomas bacterianos, que facilite la detección de nuevas cepas probióticas candidatas mediante la identificación de genes relevantes para la probiosis. Para crear esta herramienta, se han caracterizado genéticamente dos cepas probióticas conocidas (ambas Bacillus subtilis) mediante un análisis dirigido y uno masivo. El enfoque dirigido se ha basado en la detección de genes conocidos que confieren capacidad probiótica. Se han identificado genes de resistencia a antibióticos, síntesis de compuestos esenciales, enzimas, bacteriocinas, proteínas de adhesión al epitelio y de resistencia al ambiente ácido gástrico. El enfoque masivo se ha centrado en la búsqueda de genes minoritarios presentes en los Bacillus conocidos para identificar si son éstos los que confieren la capacidad probiótica diferencial demostrada in vivo. Tras estos análisis, se ha conseguido generar una base de datos de genes relevantes para la probiosis permitiendo caracterizar nuevas cepas candidatas tras su secuenciación. Para validar esta herramienta serán necesarios futuros estudios de metatranscriptómica e in vivo.