Predicción de interacción entre parejas y tríos de genes en Saccharmoyces cerevisiae usando modelos de bloque estocástico con membresía mixta

Identificador:  TFG:3033

Handle: https://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG3033

Autores:  Mariné Tena, Aleix

Resumen:
En este proyecto implementamos un modelo matemático basado en Modelos de Bloques Estocásticos de Membresía Mixta para poder hacer predicciones de la fuerza y tipo de interacción genética entre dos o tres genes del organismo modelo humano Saccharomyces cerevisiae. Utilizamos un conjunto de datos de 501510 entradas obtenidas de los materiales complementarios del artículo Análisis sistemático de interacciones genéticas complejas. Este conjunto de datos contiene los datos de fitness de mutantes de levadura knock-out triples y dobles, cada uno con una combinación diferente de genes mutados. Después de validar las predicciones del modelo utilizando diferentes métricas, comparamos cómo se relacionan los genes según los modelos de bloques estocásticos de membresía mixta en términos de ontología genética.