Búsqueda de potenciales inhibidores de la hialuronidasa mediante virtual screening

Paraules clau: Àcid hialurònic, hialuronidasa, inhibidors competitius; Hyaluronic acid, hyaluronidase, competitive inhibitors; Ácido hialurónico, hialuronidasa, inhibidores competitivos

Títol en diferents idiomes: Cerca de potencials inhibidors de la hialuronidasa mitjançant virtual screening; Search for potential hyaluronidase inhibitors through virtual screening

Àrees temàtiques: Bioquímica i biotecnologia; Biochemistry and biotechnology; Bioquímica y biotecnología

Confidencialitat: Si

Curs acadèmic: 2023-2024

Estudiant: Chantada Lorenzo, Samuel

Aprenentatge Servei: No

Departament: Bioquímica i Biotecnologia

Drets d'accés: info:eu-repo/semantics/openAccess

Data de la defensa del treball: 2024

Crèdits del TFM: 18

Director del projecte: Pujadas Anguiano, Gerard

Resum: L'àcid hialurònic (HA) és un component fonamental de la pell, essencial per a la seva hidratació i correcte estat. Amb l'edat la seva concentració en la pell disminueix per una menor síntesi i un augment en la degradació. La degradació de HA està mediada principalment per la hialuronidasa (HYAL), per la qual cosa inhibir la HYAL podria ser una nova alternativa com a tractament antiedat. L'objectiu de l'estudi és la identificació de potencials inhibidors competitius (IHC) de la HYAL encarregada de la degradació del HA en la pell, mitjançant un virtual cribratge (VS). Per a aquest propòsit, es va identificar a la HYAL2 com l'enzim més crític en la degradació del HA en la pell i es va obtenir la seva estructura de SWISS-*MODEL mitjançant modelatge per homologia usant com a plantilla la HYAL1 (2PE4). Posteriorment es va fer docking amb 15 IHC de HYAL, esmentats en la literatura científica, amb l'objectiu buscar una molècula referencia i trobar el millor grid per al VS. Aquesta molècula referència es va utilitzar per a per a identificar les interaccions clau, validant-les amb Pharmit mitjançant el càlcul del factor d'enriquiment. Finalment es va realitzar un VS en Maestro usant la base de dades de Specs preparada amb LigPrep. Les molècules van ser filtrades per les regles 5 de Lipinski; per docking usant glide XP en diversos grids validats prèviament i per cerca farmacóforica amb l'eina Pharmit. El VS va partir de les 185.380 de la base de dades preparada. Després del filtre de lipinski juntament amb docking es van obtenir 266 resultat. L'últim filtre va ser un cribratge farmacofórico, en el qual es van aplicar 3 sites validats, adquirits de IHC de referència, la miricetina. Com a resultat es van obtenir 3 molècules amb un docking score (DS) de -11,806, -10,219 i -10,008. Com a conclusió es van identificar 3 molècules amb potencial capacitat inhibitòria de la HYAL2.; El ácido hialurónico (HA) es un componente fundamental de la piel, esencial para su hidratación y correcto estado. Con la edad su concentración en la piel disminuye por una menor síntesis y un aumento en la degradación. La degradación de HA está mediada principalmente por la hialuronidasa (HYAL), por lo que inhibir la HYAL podría ser una nueva alternativa como tratamiento antiedad. El objetivo del estudio es la identificación de potenciales inhibidores competitivos (IHC) de la HYAL encargada de la degradación del HA en la piel, mediante un virtual screening (VS). Para este propósito, se identificó a la HYAL2 como la enzima más crítica en la degradación del HA en la piel y se obtuvo su estructura de SWISS-MODEL mediante modelado por homología usando como plantilla la HYAL1 (2PE4). Posteriormente se hizo docking con 15 IHC de HYAL, mencionados en la literatura científica, con el objetivo buscar una molécula referencia y encontrar el mejor grid para el VS. Esta molécula referencia se utilizó para para identificar las interacciones clave, validándolas con Pharmit mediante el cálculo del factor de enriquecimiento. Finalmente se realizó un VS en Maestro usando la base de datos de Specs preparada con LigPrep. Las moléculas fueron filtradas por las reglas 5 de Lipinski; por docking usando glide XP en varios grids validados previamente y por búsqueda farmacóforica con la herramienta Pharmit. El VS partió de las 185.380 de la base de datos preparada. Tras el filtro de lipinski junto con docking se obtuvieron 266 resultado. El último filtro fue un screening farmacofórico, en el que se aplicaron 3 sites validados, adquiridos de IHC de referencia, la miricetina. Como resultado se obtuvieron 3 moléculas con un docking score (DS) de -11,806, -10,219 y -10,008. Como conclusión se identificaron 3 moléculas con potencial capacidad inhibitoria de la HYAL2."

Matèria: Biotecnologia

Entitat: Universitat Rovira i Virgili (URV)

Idioma: es

Ensenyament(s): Nutrició i Metabolisme

Títol en la llengua original: Búsqueda de potenciales inhibidores de la hialuronidasa mediante virtual screening

Data d'alta al repositori: 2025-06-23