Treballs Fi de Grau> Enginyeria Informàtica i Matemàtiques

Porting genomics pipelines to the cloud, serverless computing as an avenue for scalable variant calling

  • Dades identificatives

    Identificador: TFG:5664
    Handle: http://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG5664
  • Autors:

    Roca i Canals, Xavier
  • Altres:

    Data d'alta al repositori: 2023-02-09
    Resum: Nowadays, analyzing large volumes of data locally has become impractical due to the computational and storage limits of personal computers. In response, the concept of cloud computing and the serverless paradigm appears. Lithops framework emerges to facilitate the development of cloud applications, based on the serverless FaaS (Function as a Service) model. In this project we present the migration to the cloud of a local pipeline for genomics data analysis based on the use of Lithops from the development and implementation of a distributed architecture based on the MapReduce model for the parallelization of the final phase of the pipeline. Avui en dia, l'anàlisi de grans volums de dades localment s'ha tornat poc pràctic a causa dels límits computacionals i d'emmagatzematge dels ordinadors personals. Com a resposta, apareix el concepte de computació en núvol i el paradigma serverless. Lithops framework emergeix per facilitar el desenvolupament d'aplicacions de núvol, basat en el model serverless FaaS (Function as a Service). En aquest projecte presentem la migració al núvol d'un pipeline local per a l'anàlisi de dades de genòmica basada en l'ús de Lithops des del desenvolupament i implementació d'una arquitectura distribuïda basada en el model MapReduce per a la paral·lelització de la fase final del pipeline.
    Matèria: Computació en núvol
    Idioma: en
    Codirector del treball: Eizaguirre Suarez, German Telmo
    Àrees temàtiques: Ingeniería informática Computer engineering Enginyeria informàtica
    Departament: Enginyeria Informàtica i Matemàtiques
    Estudiant: Roca i Canals, Xavier
    Curs acadèmic: 2021-2022
    Títol en diferents idiomes: Traslladar pipelines de genòmica al núvol, computació serverless com a via per al variant calling escalable Porting genomics pipelines to the cloud, serverless computing as an avenue for scalable variant calling Trasladar pipelines de genómica a la nube, computación serverless como vía para el variant calling escalable
    Data de la defensa del treball: 2022-06-22
    Drets d'accés: info:eu-repo/semantics/openAccess
    Paraules clau: Serverless, Núvol, MapReduce Serverless, Cloud, MapReduce Serverless, Nube, MapReduce
    Confidencialitat: No
    Crèdits del TFG: 12
    Títol en la llengua original: Porting genomics pipelines to the cloud, serverless computing as an avenue for scalable variant calling
    Director del projecte: García López, Pedro
    Ensenyament(s): Enginyeria Informàtica
    Entitat: Universitat Rovira i Virgili (URV)
  • Paraules clau:

    Ingeniería informática
    Computer engineering
    Enginyeria informàtica
    Computació en núvol
  • Documents:

  • Cerca a google

    Search to google scholar