Data d'alta al repositori: 2023-02-09
Resum: Nowadays, analyzing large volumes of data locally has become impractical due to the computational and storage limits of personal computers. In response, the concept of cloud computing and the serverless paradigm appears. Lithops framework emerges to facilitate the development of cloud applications, based on the serverless FaaS (Function as a Service) model. In this project we present the migration to the cloud of a local pipeline for genomics data analysis based on the use of Lithops from the development and implementation of a distributed architecture based on the MapReduce model for the parallelization of the final phase of the pipeline. Avui en dia, l'anàlisi de grans volums de dades localment s'ha tornat poc pràctic a causa dels límits computacionals i d'emmagatzematge dels ordinadors personals. Com a resposta, apareix el concepte de computació en núvol i el paradigma serverless. Lithops framework emergeix per facilitar el desenvolupament d'aplicacions de núvol, basat en el model serverless FaaS (Function as a Service). En aquest projecte presentem la migració al núvol d'un pipeline local per a l'anàlisi de dades de genòmica basada en l'ús de Lithops des del desenvolupament i implementació d'una arquitectura distribuïda basada en el model MapReduce per a la paral·lelització de la fase final del pipeline.
Matèria: Computació en núvol
Idioma: en
Codirector del treball: Eizaguirre Suarez, German Telmo
Àrees temàtiques: Ingeniería informática Computer engineering Enginyeria informàtica
Departament: Enginyeria Informàtica i Matemàtiques
Estudiant: Roca i Canals, Xavier
Curs acadèmic: 2021-2022
Títol en diferents idiomes: Traslladar pipelines de genòmica al núvol, computació serverless com a via per al variant calling escalable Porting genomics pipelines to the cloud, serverless computing as an avenue for scalable variant calling Trasladar pipelines de genómica a la nube, computación serverless como vía para el variant calling escalable
Data de la defensa del treball: 2022-06-22
Drets d'accés: info:eu-repo/semantics/openAccess
Paraules clau: Serverless, Núvol, MapReduce Serverless, Cloud, MapReduce Serverless, Nube, MapReduce
Confidencialitat: No
Crèdits del TFG: 12
Títol en la llengua original: Porting genomics pipelines to the cloud, serverless computing as an avenue for scalable variant calling
Director del projecte: García López, Pedro
Ensenyament(s): Enginyeria Informàtica
Entitat: Universitat Rovira i Virgili (URV)
Repositori URV