Creation date in repository: 2023-02-09
Abstract: Nowadays, analyzing large volumes of data locally has become impractical due to the computational and storage limits of personal computers. In response, the concept of cloud computing and the serverless paradigm appears. Lithops framework emerges to facilitate the development of cloud applications, based on the serverless FaaS (Function as a Service) model. In this project we present the migration to the cloud of a local pipeline for genomics data analysis based on the use of Lithops from the development and implementation of a distributed architecture based on the MapReduce model for the parallelization of the final phase of the pipeline. Avui en dia, l'anàlisi de grans volums de dades localment s'ha tornat poc pràctic a causa dels límits computacionals i d'emmagatzematge dels ordinadors personals. Com a resposta, apareix el concepte de computació en núvol i el paradigma serverless. Lithops framework emergeix per facilitar el desenvolupament d'aplicacions de núvol, basat en el model serverless FaaS (Function as a Service). En aquest projecte presentem la migració al núvol d'un pipeline local per a l'anàlisi de dades de genòmica basada en l'ús de Lithops des del desenvolupament i implementació d'una arquitectura distribuïda basada en el model MapReduce per a la paral·lelització de la fase final del pipeline.
Subject: Computació en núvol
Language: en
Work's codirector: Eizaguirre Suarez, German Telmo
Subject areas: Ingeniería informática Computer engineering Enginyeria informàtica
Department: Enginyeria Informàtica i Matemàtiques
Student: Roca i Canals, Xavier
Academic year: 2021-2022
Title in different languages: Traslladar pipelines de genòmica al núvol, computació serverless com a via per al variant calling escalable Porting genomics pipelines to the cloud, serverless computing as an avenue for scalable variant calling Trasladar pipelines de genómica a la nube, computación serverless como vía para el variant calling escalable
Work's public defense date: 2022-06-22
Access rights: info:eu-repo/semantics/openAccess
Keywords: Serverless, Núvol, MapReduce Serverless, Cloud, MapReduce Serverless, Nube, MapReduce
Confidenciality: No
TFG credits: 12
Title in original language: Porting genomics pipelines to the cloud, serverless computing as an avenue for scalable variant calling
Project director: García López, Pedro
Education area(s): Enginyeria Informàtica
Entity: Universitat Rovira i Virgili (URV)
Repositori URV