Trasladar pipelines de genómica a la nube, computación serverless como vía para el variant calling escalable

Identificador:  TFG:5664

Handle: https://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG5664

Autores:  Roca i Canals, Xavier

Resumen:
Avui en dia, l'anàlisi de grans volums de dades localment s'ha tornat poc pràctic a causa dels límits computacionals i d'emmagatzematge dels ordinadors personals. Com a resposta, apareix el concepte de computació en núvol i el paradigma serverless. Lithops framework emergeix per facilitar el desenvolupament d'aplicacions de núvol, basat en el model serverless FaaS (Function as a Service). En aquest projecte presentem la migració al núvol d'un pipeline local per a l'anàlisi de dades de genòmica basada en l'ús de Lithops des del desenvolupament i implementació d'una arquitectura distribuïda basada en el model MapReduce per a la paral·lelització de la fase final del pipeline.