Identification of sensitivity to herbicide glyphosate by docking on the target enzyme 5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase

Identifier:  TFG:4375

Handle: https://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG4375

Authors:  Sánchez García, Daniel

Abstract:
L’enzim EPSPS forma part de la via del shikimat, sent clau per la síntesi dels aminoàcids aromàtics. La presència de l’enzim s’ha detectat en diverses microbiotes. El glifosat és un herbicida que pot inhibir l’enzim. Es vol distingir les variants de l’enzim amb programes de docking proteïna-lligand basats en l’anàlisi de les conformacions que pot adoptar el glifosat al centre actiu de l’enzim. Els resultats demostren que és possible la distinció dels enzims EPSPS, classificant-los com a potencialment sensibles o resistents al glifosat. Tanmateix, s’observa que la distinció és problemàtica per una sobre-representació d’enzims mutants al Protein Data Bank.