Identificación de activity cliffs en compuestos que se unen a la proteasa Mpro del SARS-CoV-2

Identificador:  TFG:2968

Handle: https://hdl.handle.net/20.500.11797/TFG2968

Autores:  Albert Cañamero, Òscar

Resumen:
Los activity cliffs son parejas de compuestos que representan estructuras muy similares pero que tienen una diferencia de actividad muy alta. Estos permiten capturar modificaciones químicas que influyen en la actividad biológica, por lo que son de gran utilidad e interés en el análisis de la relación estructura-actividad de los compuestos. En este proyecto se han buscado activity cliffs entre moléculas que inhiben la Mpro del SARSCoV- 2 i moléculas que no la inhiben. Para hacerlo se ha desarrollado una aplicación que permite encontrar activity cliffs mediante la representación en un dendrograma de las moléculas de dos arxivos según la similitud entre estos (un archivo para las moléculas que inhiben la Mpro del SARS-CoV-2 I moléculas que no la inhiben). Para calcular la similitud entre moléculas se utilizan fingerprints I el cálculo del índice de Tanimoto entre los fingerprints de las diferentes moléculas. La aplicación permite diferenciar qué compuestos pertenecen a cada archivo I muestra la estructura de las moléculas cuando el usuario interacciona con el nombre de estas en el dendrograma. En total se han encontrado 18 activity cliffs entre todas las moléculas analizadas.