Comparison of spatial transcriptomics technologies across six cancer types

Entitat: Universitat Rovira i Virgili (URV)

Confidencialitat: No

Ensenyament(s): Ciència de Dades Biomèdiques

Aprenentatge Servei: No

Títol en diferents idiomes: Comparació de tecnologies de transcriptòmica espacial en sis tipus de càncer

Resum: La biologia espacial integra paisatges moleculars i histològics per revelar l'arquitectura de la biologia dels teixits, crucial per entendre teixits multicel·lulars complexos. Les plataformes avançades de transcriptòmica espacial caracteritzen l'expressió gènica espacialment, transformant el nostre coneixement sobre l'organització i la comunicació cel·lular. Això és vital en la investigació del càncer, on l'evolució del tumor està influenciada per les propietats genètiques, el microambient del tumor i l'organització espacial. Comparant quatre plataformes de transcriptòmica espacial (VISIUM, VISIUM CytAssist, Xenium i CosMx) i una plataforma de proteòmica espacial (VISIUM CytAssist) en sis mostres de tumors humans, l'estudi va trobar que VISIUM amb CytAssist va obtenir una qualitat de dades superior. Xenium va excel·lir en la detecció de gens i el perfil multiòmic va destacar els desajustos d'expressió de proteïnes d'ARN, subratllant la seva importància.

Matèria: Biologia espacial

Curs acadèmic: 2023-2024

Idioma: en

Data de la defensa del treball: 2024-06-20

Àrees temàtiques: Ciències de la salut

Estudiant: Cervilla García, Sergi

Departament: Enginyeria Informàtica i Matemàtiques

Data d'alta al repositori: 2025-03-13

Paraules clau: càncer, biologia espacial, comparativa

Títol en la llengua original: Comparison of spatial transcriptomics technologies across six cancer types

Drets d'accés: info:eu-repo/semantics/openAccess

Director del projecte: Vinaixa Crevillent, Maria