Treballs Fi de MàsterEnginyeria Informàtica i Matemàtiques

Comparison of spatial transcriptomics technologies across six cancer types

  • Datos identificativos

    Identificador:  TFM:1889
    Autores:  Cervilla García, Sergi
  • Otros:

    Entidad: Universitat Rovira i Virgili (URV)
    Confidencialidad: No
    Enseñanza(s): Ciència de Dades Biomèdiques
    APS: No
    Título en diferentes idiomas: Comparación de tecnologias de transcriptómica espacial en seis tipos de tumores
    Resumen: La biologia espacial integra paisatges moleculars i histològics per revelar l'arquitectura de la biologia dels teixits, crucial per entendre teixits multicel·lulars complexos. Les plataformes avançades de transcriptòmica espacial caracteritzen l'expressió gènica espacialment, transformant el nostre coneixement sobre l'organització i la comunicació cel·lular. Això és vital en la investigació del càncer, on l'evolució del tumor està influenciada per les propietats genètiques, el microambient del tumor i l'organització espacial. Comparant quatre plataformes de transcriptòmica espacial (VISIUM, VISIUM CytAssist, Xenium i CosMx) i una plataforma de proteòmica espacial (VISIUM CytAssist) en sis mostres de tumors humans, l'estudi va trobar que VISIUM amb CytAssist va obtenir una qualitat de dades superior. Xenium va excel·lir en la detecció de gens i el perfil multiòmic va destacar els desajustos d'expressió de proteïnes d'ARN, subratllant la seva importància.
    Materia: Biologia espacial
    Curso académico: 2023-2024
    Idioma: en
    Fecha de la defensa del trabajo: 2024-06-20
    Áreas temàticas: Ciencias de la salud
    Estudiante: Cervilla García, Sergi
    Departamento: Enginyeria Informàtica i Matemàtiques
    Fecha de alta en el repositorio: 2025-03-13
    Palabras clave: cáncer, biologia espacial, comparativa
    Título en la lengua original: Comparison of spatial transcriptomics technologies across six cancer types
    Derechos de Accesso: info:eu-repo/semantics/openAccess
    Director del proyecto: Vinaixa Crevillent, Maria
  • Palabras clave:

    Ciencias de la salud
    Health sciences
    Ciències de la salut
    Biologia espacial
  • Documentos:

  • Cerca a google

    Search to google scholar